Detailed information on CNT30159366


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SSN3|TIR_ARATH, E-value = 1e-11

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
nothing found

Expression of CNT30159366

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (52 aa)
MIKFAVMSQTVLNIVVNAVTRKLSCSSASTFMNLKKVLVGVSFIFGETTNAG*

>peptide 2 (37 aa)
MFSLLVSRLENHGLDRNVEIVPNVKLFHEFHTEMFFD*

>peptide 3 (37 aa)
MCLGFPFKSHVFSLGFKVRKSWAGSECGNCPQREAIP*

>peptide 4 (38 aa)
MVSSMLTGNEDGFCQKTWHDWGKLLFLNQLTYPPKVSS*

>peptide 5 (40 aa)
MQLKNREFQLLFSQETMFLLFGAWLNLLRLLDVRRHWDKK*

>peptide 6 (43 aa)
MQAKKRCQWFHGSSSQFPQHGPLFFFYVNIRTLKSFDTLIISY*

>peptide 7 (42 aa)
QIPTQGHRLCYLSSAIFSHHYRLLSRVIKSHRIQLMSVGSAA*

Sequence

>CNT30159366
CAAATCCCTACACAGGGACACAGGCTATGCTACCTATCGTCTGCTATCTTTAGCCACCATTACCGCTTGCTGTCTCGTGTGATTAAATCCCACCGAATCC
AGTTGATGTCGGTCGGTTCGGCTGCTTAGCCGTGATCTTACCGTCTAGCGCCGCGACTCATGGTTGGACTCGGTTGTTTGGCCGTTTGGACGATCGCGAC
CGGATTTGCTCCGATTCAGCCGTTCGACCTGGGTTGAATACTTTTGTCTTGCAATTACTTTGGCTCCTCTGCATCCGATTCCGATATCTTAATCAGTTTC
AAATCTATGTTCGATTAATTAATGATTGCTTCAAAATTGTTTGAATGACATTGCAAGACAGTTGAACCATGGTTTCAAGTATGTTGACTGGAAATGAAGA
TGGCTTCTGCCAGAAGACGTGGCATGACTGGGGAAAGTTGCTGTTCCTAAATCAATTAACTTATCCGCCAAAAGTATCCAGTTGACTGCTCTCTTTCTTT
CTTTTCATTTATTTTAAAGTTCAATTAATGGATGTGTTTGGGTTTCCCTTTTAAATCTCATGTTTTCTCTCTTGGTTTCAAGGTTAGAAAATCATGGGCT
GGATCGGAATGTGGAAATTGTCCCCAACGTGAAGCTATTCCATGAGTTTCACACGGAAATGTTCTTCGACTGATCAGATTAAAGTTCTTTTGGCGAAAGC
TTGTCCTGCATAGGAGGAATCTGGTTACATAGACAGACTTGTAACTTGCATAAACAAAGCTAGTTGATTCAAGTCAATTGATAGTTGTTTTCATCATGAG
CATCCAAAGAGTCTCTTCATATGGATCTTCTTCCTCTGGTTGGAAATATGATGTGTTCCTAAGTTTTTGAGGTGAAGACACCAGAAAGAATTTCAAGGGT
CATCTCTATTATGCTTTGACTCGTAAAATTGGAATCGTAAACCTAAACCCTAAACCCACCAATTGATCCACATCATAGAAAATTGGAACCACTTTTTGTC
CCAATGTGTTCTTACATTCAATAATATTAACAAGTTTATCCAAGCACCAAGGAGAAGAAGCATAGTTTTTTGAGAAAACAACAATTGAAATTCTCGATTT
TTCGATTGCATGAAGGGGTTTTGATGAAATGGGTTTTTCTATCTCAAGTTCTTTGACTCCTTTATGAGTCAAAACAGAATAGAGATGATCAGTGAAATTT
TGCTTTGACTCATAAAGGAGTCAAAGCACTCGGGATAGGAAAACCCATTTCATCAGAACTCCTAGATGCAATTGAAAAATCGAGAATTTCAATTGTTGTT
TTCTCAGGAAACTATGTTTCTTCTCTTTGGTGCTTGGCTTAACTTGTTAAGATTATTGGATGTAAGAAGACATTGGGACAAAAAGTGATTCCAATTTCTA
TGATGTGGATCAATTGGTGAAAGAAAACAGATGGGTAATTTTGAGAAAGCATTTGCTAAGCATGAAAGAAACCATGCTTCTTCTCCTTGGTGCTTGAATA
GAAGTGATTAATATCTATCGAAGAGATTTGCAGGATAGGTATGTAAATTTCATTTTTTCTTTCTTTCCGTGCTTGTATAAAAATAGCTGGTGATAATTAT
TTGATCGACAGTTTTAATTATTGTGGTTTATGATAAAATTTGCAGTTATGAGTCAGACTGTATTGAACATTGTTGTTAATGCAGTAACAAGAAAATTAAG
TTGTTCATCAGCTTCAACATTCATGAATCTGAAGAAAGTTTTAGTTGGAGTGAGTTTCATTTTTGGAGAAACTACTAATGCAGGCTAAAAAACGATGCCA
ATGGTTCCATGGAAGCAGTTCTCAATTTCCCCAACACGGACCTCTTTTTTTCTTTTATGTTAATATCAGGACATTGAAATCATTTGATACATTAATTATA
AGTTACTGAAATTTGAAGTCTGTAAATAGAAATGATAAATATGTTCAAGATTGAAATATAAGA