Detailed information on CNT30117112


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONOSAT000754, E-value = 2e-140

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30697179Oryza nivaraOryza sativa13.0876.2199.42519forward
CNT30104218Oryza nivaraOryza rufipogon26.0752.6597.781034forward

Expression of CNT30117112

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (94 aa)
MHNLYGLFCIPMNIVARVGQPSNFPPGHLFLSFSPLPTEEAEELRVTRPPLLESFPSFPLQWNPRRQPHLKLLHTPSRQQTDWGHLFTEAAAAQ*

>peptide 2 (31 aa)
MPVAAAKMWSGVVVEGVAVAMTMTCLAFLLV*

>peptide 3 (29 aa)
MHALAFLCSLGIWIILCCSRRRSVDAHLR*

>peptide 4 (32 aa)
MYLSYRCVRAYDTRCICTISIAIFMILKIQQK*

>peptide 5 (32 aa)
LSLLITLRSERMGTRVHGTGATIVNNLRLGYD*

>peptide 6 (37 aa)
MLCQYNERCNASSDYSYNNSTQGSIFQNGTSGISPLQ*

>peptide 7 (37 aa)
MHNPRCFSEELHRSCRPQAFCVCTLVCASYRGWIIYA*

>peptide 8 (35 aa)
MQTGLQIFISLTNFHVGGISIPVGFSCWCCRRLDG*

>peptide 9 (36 aa)
MSHRCVRAYDMRCICLIVAFGHMIRDVFVLYPLQFS*

>peptide 10 (48 aa)
MSKRMQRRSRLLKLYQLTDPGLDTVKYVGFRIISFGTRQWRDAHGQCA*

>peptide 11 (53 aa)
MHDKSRNKCCTLIELIKPLFKVVHNATKPNQNKHIMPSNRINKCLAPQTFAPA*

>peptide 12 (39 aa)
MSDVMHRVIIPIITVHRVQYFRMELLEFHPCNRILRPKI*

>peptide 13 (41 aa)
MCHTCRMCGLASCMACSRGMSWLHACTCLPVLPRHLDHFML*

Sequence

>CNT30117112
TCCTCTCGCTGCTGATAACGTTACGTTCAGAGCGCATGGGGACTAGAGTTCATGGAACAGGTGCCACTATTGTTAATAACCTAAGGCTGGGCTACGACTA
AGCTAATGAATATTGGCAAGTCGTGGATTGCGGGTAAAGCGTACATTTACTGCAATAAAGTATAAATGAATCTATTCGAATAGCCGTGCTCACGGATTGA
GTATCAGGACTCATATGGTATTTGGTTAGAAACCTAATTCAAGACTTTACTAAATACTGTTGCATAAAGACATCCCAGGCTTTCTTCCTCTATATTCTCA
GCTTTCTGCAATTGAATCAATTGTTGATTAATACATTTCATACATTCATTGTTGATTAATATAATAGCTTGCTGAGTACGTTGTACTCACCCTTGCTTCA
ACCTCCTTTTTCAGAGTCCATTAGATGTTCTTGCCGAAGTCAGGAGTTCAATCACATAAGTTAATTCCCTTTTTACTTAATCTTCAAGTCTAGGTTATTT
ACATGGTTTAAGTCTATAGTAAAACAACAGAGTTAGGTCATTCTAAAACTTCTGCTGTAATAGTTAGCCACAATCTCGTAAATACCCTATTACTTTATGT
AATAATATCTTCTTCAAAGCTATGTCTAAACGTATGCAAAGACGATCCAGATTGTTGAAGCTGTATCAACTTACTGATCCAGGGCTTGATACAGTTAAAT
ATGTCGGTTTCCGAATCATTAGTTTTGGGACCCGACAATGGCGCGATGCGCATGGTCAGTGTGCGTGACAAATAATGTCTCATCGTTGCGTTCGGGCATA
TGATATGAGATGTATTTGTCTTATCGTTGCGTTCGGGCATATGATACGAGATGTATTTGTACTATATCCATTGCAATTTTCATGATTCTTAAGATTCAAC
AAAAATAATTACCAAAATAGTCTTCTTTTAGCCTAGATTTCTTAGTGACGAAATTGATTTCACATTCTTTCTAATGATTATGCTTTATGTGCAAATGTTT
TTTTCCAATTTTTAGGGATATTGACATATAGTCGTTTCTCTAGGGAAACAATATTGTCAATAATCGCTGTGTGCTATTCGAAAGATAGTTCAAATCTTTT
CACAGATTGAACTTGTCTTGCATCTCTCAATTTTGTATTTTGTGATGCTTCTTTTCACAATGTTTATTTCCTCTTCAACATAGGCTATACAAATTGTCTA
TGGAAATAAAGTAAAACATCACTATTTCATAATAAGGAGTAATAATTTATAATATAACTAAGTGTAATAATATCAAAAATAAATTCTAGCCATGCATGAC
AAATCACGGAATAAATGTTGTACTCTCATAGAGCTTATAAAACCATTATTTAAAGTTGTTCATAATGCAACCAAGCCAAATCAAAATAAGCACATTATGC
CCTCAAACAGAATAAATAAGTGTTTAGCACCACAAACATTTGCTCCTGCCTGACATTCTCTTCACGTGTTATGCCTGTTGCAGCGGCAAAGATGTGGAGT
GGAGTAGTAGTGGAGGGAGTTGCCGTGGCGATGACGATGACGTGCTTGGCCTTCCTCTTGGTCTAGAATATGTCGATGATGTGCTCGGGCTCCTCACAGA
TACGGCTCCAGCAGCCCCATGTGCCACACCTGTAGAATGTGTGGTCTTGCTAGTTGTATGGCTTGTAGTCGTGGGATGTCTTGGCTTCATGCATGCACTT
GCCTTCCTGTGCTCCCTAGGCATCTGGATCATTTTATGTTGTAGCCGACGGCGCTCCGTGGATGCGCATTTGAGGTGAGAAAAACATTATATGTGCCGGT
TTTTACTATTCCGGCACTATAACCTATAGCGCCGTATCCTTTATTTGTTTTTTAAGTAGTGTTTCTCTCTTATTCTCTCTCTATTTTTAAGCTATGCTAT
GCGGTAGATTGAGAGTGTTTTAAAAACGTCGCACGTCAGCTTAACTGGGTATTTTATATTGATAATATTTTTTGAACAAAGAATCCTATATATCTATACA
TACAATTGATCCCCACTGAGTATCAATGATGCTATTTTCCAGCCCTATGGTGAAGCCACGTCACTTCAATTAATTTTAGCCATCAGATTAGATTTGTCTG
TCCGAGATTTCTTCTTTCTCCACCATGCACAACCTATATGGCCTTTTCTGTATCCCAATGAACATTGTTGCGAGAGTAGGACAGCCCAGCAATTTCCCAC
CAGGCCATTTATTCCTCAGTTTCTCTCCCCTACCAACCGAGGAAGCCGAGGAGCTTCGCGTTACTAGGCCGCCGCTGCTAGAATCTTTCCCGTCGTTTCC
TCTACAATGGAATCCGAGACGACAGCCTCACCTGAAACTGTTACACACGCCTTCACGTCAACAAACTGATTGGGGGCATTTATTTACCGAAGCTGCAGCG
GCGCAGTAATGGCCTTCAGCCTTCTTCTCAATCTCCCTCCTCCCTGTCCTCCTCAGCTTCTCCACATGAGGAGTACTAATCATTAAGTTATCCTCTTCTT
TATAAACTCCCTGAAGGCGGCTCCATTGCATATGCCGAAAATCTCTGTCTGTCTCTCTCTGAACTAATGCAAACTGGATTGCAAATTTTCATTTCACTGA
CAAATTTTCACGTTGGAGGAATTTCCATTCCGGTGGGCTTTTCTTGCTGGTGCTGCAGGCGCCTGGATGGTTAAATTTTCAATGATATTTTTGGTATATG
TAGAAGAAAATGCATAATCCACGTTGTTTTTCTGAAGAATTGCACCGCTCCTGTCGTCCTCAAGCATTCTGTGTTTGTACCTTGGTATGTGCTTCCTACC
GAGGATGGATCATATATGCTTAAAATTCATCCTCCTTGTCCAGGCTTAAAGGAGATGTAGACGTCTTCGTCACTAAAGTTAATGCTTACAAATATATTCT
CTTAAATCCCTAATCTGTTTTTACTCAGAAGGACTAGCTAGCTACTCAGTATTTTTTTATTTAGGGTTACCATTAGCTGCATATGTAACTCTGATTTTGT
TGAGATTTACTTTACCGTTCAATATTAAAACTGGAATACTGTGGAGGGTTCCAAAGCAACCCTAGCTGCAACTACACCGATGGATATAAAAGAAGGTTTC
TTTGCAAAACCCCAGGACCTGCTTTCTTAATTTGTATCACGAGCAAAACCGAAACATCAATTTTCACATGCTCTGCCAGTATAATGAGCGATGTAATGCA
TCGAGTGATTATTCCTATAATAACAGTACACAGGGTTCAATATTTCAGAATGGAACTTCTGGAATTTCACCCCTGCAATAGGATATTACGGCCAAAAATT
TGAGTATTTTTAGTTAACGAAAATTCATTCAACTTTCAACTTTTTCAGCCAGAAATTTCCACAATTTCGCTTCTATCAGTTCCCACTGAAATATTTAGAT
TTTCAAGTTTTAGATTTTTTTTTTTTGCAATTTCAAACTTGCAGTACACTTGGTTAGTTTTGCAAGCTTAATTTGACTATAAAATAATTTCGATTTTAAA
TATGTTGAAAGATCTTAACAAAATTTTAAATTTGTTGAAAGTTCCTATTTTCATTTAAGAAGAAGAGAGGTGGCCTAGTTTTTAGGGAAAACCGGGCCCG
AAAACCTCATAAGTGCGTGGTTAATTAAGGGAAACCAACCAAAGACCCACATGAGGAACAGAACAGTACACATGGAGCAGAACTACTGAAGTTCGAAACA
AAAGTCATCGTTGCCAAGCTCAGAGGAGCAGCTCCGACTTCTTAAGAACAAACTACGAACTAGCTAGGCGACCACAATGACAACGTAGGGCAGGGTCTTC
CAGACGAAACCTCCAAGGAAAAGCGTCGGAGACACAAACAACGTCCGTCCAAGAATCGGAATAAAGTTTTCACCCGAAGAAAAGGAGAGCAAGCGACAAC
GCCTTCAGGAAGGGAACGGCGCCCACAGGCGTTGACGTTATCAGCCGTAGTCAAAGACCAAGCAGGG