Detailed information on CNT30110571


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002741, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30691190Oryza longistaminataOryza sativa14.278.2698.54893reverse complement
CNT30552795Oryza longistaminataOryza glaberrima7.1144.1781.66447reverse complement
CNT30100438Oryza longistaminataOryza rufipogon19.4285.9394.11221forward
CNT30575232Oryza longistaminataOryza barthii5.4744.6284.59344reverse complement
CNT30116012Oryza longistaminataOryza nivara7.1647.8791.33450forward

Expression of CNT30110571

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (69 aa)
MCLHLNLAAFLYQTFLGFFLDVSFSVLSLNLTFVSRVTVFFFNIKFQLGTLSLISSVTIFLFLELLFEL*

>peptide 2 (47 aa)
MHLNLAAFLCSGVLIVDLELSSRVSCPYLSKIISWLHARHLHLVASY*

>peptide 3 (89 aa)
MLHFPSFRLNHIIFVGFLYFRKFYCINVFDMLFGFMKIVVCLSEQFIGFSVDAFENFVRTYAYLFVKGKYVLAFKPCGFFVSNVSRFLP*

>peptide 4 (82 aa)
MSRINSLKNNFLERIVLWHVRNTKYLHKHCIISYMHRIISFIMISYIHLCLFEKKKSYCCTCHLASRFLPQPSLWMHIMRPS*

>peptide 5 (32 aa)
MQIIVCLSLTIYWFLRYASFLIHAFCCTSKPL*

>peptide 6 (35 aa)
MLHFPSFRLNHMLFVGFLYFRKFYLINAFDMLFGL*

>peptide 7 (31 aa)
MAQCANFVTLYGRMQDLYIVATHNMVWELHF*

>peptide 8 (31 aa)
MSKNSTSLILWDGGSINLCLLVCEKKIFACI*

>peptide 9 (42 aa)
MKIMVSLYQTFLVSSLDASFSILSFKPYAFRWISLFSKVLFD*

>peptide 10 (42 aa)
MKIMVSFYQTFLVFSLDASFSILSFKPYYFRWISLFSKVLLY*

>peptide 11 (35 aa)
MIWFPSPYVISAPKKMNLVDFELLSSDISNFTDMV*

>peptide 12 (41 aa)
MKIMVCVYQTFLVFSLEMCCVECVCACDDDIMPCQGRQLCL*

>peptide 13 (29 aa)
MLDIYIWLHPIDFIRTIVCLFGTICWFLR*

>peptide 14 (29 aa)
MVRDSKSGILEKFYKHLKSIISYCYRKTT*

Sequence

>CNT30110571
ATTTTTTATCCATAAGTTTAAAATTTTGTACTTTTAGTTGGATTCCTTGATTTTGTAACGTTCTTCTTGCATTGATTCTTCAAATATCCTTTTTGGAGTT
TGCAATTTTTTTCGTTGTCACGGTTAATCTTCCTTAAGTTTGTTTGAACTTTTTTTTTCTGTTTTATAAAAGCAAAATATTCTTTTGCATTGAAGCCTGA
CCGTTTTATTTTGCTCTGACGTTAATTTTGAACTTATTAATTGAGTTGTTTGGATTCGTCTTCTTGTTTATTGAAAACAAATAACATCGTTGTAAACTGG
ACCCATACATTCTGTTGCACCTTGAAGCTTTTATAAAAATCTTGATTTCCTTGTATCGATCGTTTTTAGGTTTGTCCCTTCACGCTTCAATGTTCCGTCC
TTTCATTCAAACTGAACGCTTTTAGTTGGATTTCTTTATTTTCGAACTTTCTCTCCTACTAATGCTTTTGATGTTCTCTTTGGACGTTAAAGCTTTAATT
CAGTTTTGAAATATCAGATTTCCTAAATTTTGATTGAACTTATGCTTACTAGTTAGTGAAAAGAAAATATTTCCTTGCATTTAAATCTTGGGCTTTTTTG
TTCTCTACCATTTTCATTTTCGATTTATAACTCATTTTCCGTCCTTTCGTTGAATCTTACTTGCGTAACGGGTTTTTCTTTCAACATTAGGTTTCAACTC
GGTACTTTAAGTTTGATTTCTTCAATTACAAATTTTCTCTTTTTGGAACTTCTCTTTGGACTATAAAGCTTTATTTTAGTTTTGAAATCTCAATTTCCTA
AATTTTGTACTCCCTCCGTCCCACAATATAAGGGATTTTCAGTTTTTGCTTGCGACATTTGACCACTCGTTTTATTCAAATTTTTTTTCAAATATAAAAA
ACGAAAAGTTGTGCTTAAAGTATTGTAGATAATAAAGTAAGTCACAAATAAAATAATTAATAATTTTAAAAAATTTTGAATAAGACGAGTGGTCAAACGT
TATGAGCAAAAACTCAACATCCCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTATAAACTTATGCTTACTAGTTTGTGAAAAGAAAATATTTGCTTGCATTTAAACC
TTGCGGCTTTTTTGTGTTCCGGCGTTTTAATAGTAGACTTATAACTAATTTAATTTTTGTTGTTACGTTACCTTGTTTATCGAAAAAAAATACTTTGTTT
ATCGAATTTGTGTAGCCCAATCTAGAAGGGATAAAATCTTGGTTCGTTCAGGGTAGCTCAAAAGGTTACCCATCAATCTCTCTGATTTTCTTTTTAAAAA
TTTCTTATGAACCTTTAGAACTTACCTAAAAATTAGGTAAAGATAGTAGACCGATAAATTCCAGCACTGCATCACTTGTCTTGCCCAATTTCTCTAAAAT
AATCTATTTGTCCAAAAAATCAACATTCCTTCCCAGATAGGAGAAAACTTTGTTACGATCATGGATATAATTTTTTTCTAATTTATCACCCATCTAGCAT
AGTCTTTTGCTTCAGTATGCGCCTCGGGACTGGATAGTACAGCATATGGGCACATACACCTATTTAGCTCTTCCATTAAAATTTCTTGATAAACCCCATT
GCTTTTATTTTATTTTATTTTAAGGGGGATAGAGTGCCATGACCTTACAAACCAGAGACAAAACATGTAACCTTTGCAAGCCCCCACAAGCCTAAATGGA
AATATCATACTAGGAACAAGTCGTAAGCAAACTATGTAATTTAAGTTGAGATGGCTCAGTGTGCAAATTTTGTGACCCTTTACGGTCGGATGCAAGATTT
GTACATCGTAGCAACTCACAACATGGTTTGGGAACTTCACTTTTAGGTTTTGAAAACTTCTCTAAGATAATCCATTTGTTTTAAAATTACCATCTCTTTC
CTAGATAAGGAGAACTTTGTTACGAGTCTAGGTAAAAAAATGTTTAATTTTGTCACCTTATCCTAGCCTATAGCGTATAAAGAGTTACAACCATTCCAAT
GCCCATGAAAAACCATGAGTAGGATCAATAGTCTCAAGAACAATTTTCTCGAAAGGATTGTTCTATGGCATGTACGCAATACAAAATATCTTCATAAGCA
TTGTATCATATCATACATGCATCGCATCATTTCATTCATCATGATATCATACATACATCTTTGCCTTTTTGAGAAAAAGAAAAGTTATTGCTGCACATGC
CATCTAGCATCCCGTTTTCTACCACAACCAAGTTTATGGATGCACATAATGAGACCGTCCTGATGCATCTAGTATGACTCGACAAATATTCCTAGAACAC
CTTGGATTAGATTGCATATGACTAATTAGCAACTGGAGAACAAATATTGTCAACCCCTAAGATGTAACCCAGAGTTTTGTTCAATTTATTCTTATTTTCC
CAACCGCCTTACCTGCTGTCCTAAAACTTAAATTTATCGAATGTGAGATCAACAAGGTTAGATCATGACTGTAGACCATGAAGACTTGAACCTTGTTACA
TCCTAATGGTTAGAGATTCTAAATCAGGTATTCTTGAAAAGTTTTATAAACATTTAAAATCAATAATATCGTATTGTTATCGGAAAACAACATAGCCATG
ACACCTTAGATCGTATTCCACCAACCAAACAAGGATAGGTTCTCATACCACCCCCACCAAAGACAAAATCATCGTAAGAGCCACATAAATAATATGAATT
CCTAAGTAGGCTGACCCATATTCGAAAAGGAAATAGTTGCATGCATTTAAACCTTGCGGCTTTTCTGTGCTCTGGCGTTTTAATTGTAGACTTAGAACTA
AGTTCAAGAGTTTCGTGTCCCTATTTATCGAAAATAATATCTTGGTTACATGCTAGACATCTACATTTGGTTGCATCCTATTGATTTTATAAGAACCATA
GTTTGCTTGTTCGGAACGATTTGTTGGTTTCTCCGTTGACGCTTCATTTTTAATCCATAACTTTTCGTGAGCTGCACCCTTGCATTTTGTTGCATATCTA
TGCCTTTATGAAAATCATGGTTTCATTTTATCAAACATTTCTAGTTTTCTCCCTTGATGCTTCATTTTCCATCCTTTCGTTTAAACCATATTATTTTCGT
TGGATTTCTTTATTTTCGAAAGTTCTATTGTATTAATGTTTTTGACATGCTATTTGGTTTTATGAAAATCGTAGTATGCTTGTCCGAACAATTTATTGGT
TTCTCCGTTGACGCTTTCGAAAATTTTGTTCGAACATATGCTTACTTGTTTGTGAAAGGAAAATATGTGCTTGCATTTAAACCTTGCGGCTTTTTTGTAT
CAAACGTTTCTAGGTTTCTTCCTTGATGTTTCATTTTCTGTCCTTTCGTTGAATCTTACTTTTGTTTCTCGCGTAACGGTTTTTTTTTTCAACATTAAAT
TTCAACTTGGTACTTTAAGTTTGATTTCTTCAGTTACAATTTTTCTCTTTTTGGAACTTCTCTTTGAACTTTAAAGCTTTATTTTAGTTTGTGAAATTTT
GTATAAACTTATGCTTACTAGTTTGTGAAAAGAAAATATTTGCTTGTATTTAATCCTTGCGGCTTTTTTGTGCTCCGACATTTTAATAGTAGACTTATAA
CTAATTTAATTTTTATAGTTATGTTACCCTGTTTATCGAAGAATATCTTGGTTGCGAGCTAGACGTCTACATTTGATTGCAGCTTACTGATTTTATGCAA
ATCATAGTTTGTTTGTCCCTAACGATTTATTGGTTTCTTCGTTACGCTTCATTTCTCATCCATGCATTTTGTTGCACATCCAAGCCTTTATGAAAATCAT
GGTTTGCGTGTATCAAACATTTCTAGTTTTCTCTCTTGAAATGTGTTGTGTTGAGTGTGTGTGCGCGTGTGATGATGATATTATGCCTTGCCAAGGAAGG
CAGCTATGCTTATGATGGTACTATGATGTTCTTTATGATATAATTACAGAATTTGTTTTGTTAATTGAATCATCAACTCCTTTGAAAGGAATTGTGAACC
AAAACTTGCTTTACGCTAAAATTTAACTACATATAGCCTTCCTTGAATATATGCCCTGCATGTAATATGTTAGAATTGCTTTAGGCTTGGCAGTACATTA
TTTCTAATGATGTACTGACTCTTGTTATACTAGAGTATCCATTTTTGTAGGTTGTATGCTTAGTGTTTATTGAGTGATGCGGGTTTCAACCGCTTCTTCT
AGGAATTAGATTCTAATTGGGGTCAACCCCCTAGTCGGTTTGCTTGTGGTTTGGGTAGGCAAGCTTGCGCGAATCTCTGATTATTTGGCTAGTTGGCCTA
TGTATAACTAAAGTAGTTGTAATTGAATTTTGTTTGTCTTGTATTTTCTTCTGTGTATCATTGCTTAAGATGAAAGTGTGAAGCTAGTGCATATCCTAGG
AACTAGTTCCACATGAGTAAGGGTTTAGGATATTTGGGATGTCGTAGAGNNNNNNNNNNGGTTTAGGATATTTGGGATGTCGTAGAGCTTTAGCTATTTT
CGTCAAGTTTCCTGAATGTGTAACACATCTAGTCGCTGCCTTCGTGTGGTTTGACGGACACATCTCAGGCTGAAGTTGACTGGCAAGCTAAAGTCCCAGC
AATGTCTCCTATATCCTTTACTTGAGGCTTCGGATTTTACATTATGCCTGCTACTTGATTTGAATTGTTCACTTCAATTGGCAGATATAATGTAAAGTTC
AGGTGTCCTCCACAGGCATGGTACCAGAGCTAATACGGACTATAGGAACCCCTTAAGTTGGTCGTTTAGAATGGTTTCTTAAAATTATTTTGAGGGTTTT
GCTCTCAGCTACAAATTATTTTGCGAAAATCATATTCAACCTTATATATCATCCCTCTCTAGAGATTACTTTCCTCTAGGTCTCTATTTTGATTTTGAAA
ACTCTTATCTTGCTCTATAGGACCGAGACCTTTTGAAAGCTTGTACTAAAGTGAAAATGAGTTTGAAAACACTTATTAATCATAAAAAATCAGTTCCAAA
GTGTTTTGAAAAGTTTTGAAATCCATTTGCAATCACCTATGTACTAGTACGGATTTGCAAAATATCGGGTTAAAAATAGCCTCTAGTTATAGGATTTGAA
AATGGATGGATAAAATTTAAATCTTGAAAGACATGATATGGTTTCCATCTCCTTATGTTATCTCTGCACCAAAAAAAATGAATTTGGTAGATTTTGAACT
CCTCTCTTCCGACATTTCAAATTTTACTGACATGGTCTAGAATGGGTAGTTTGTGAAGGATAAAATTGTTGTGCTTAAACCTGTAGATTGTTGCTTAGAT
GGACCACCCAAAATTCACATAGCCTCTGTACCACCCTAACCTAATGTAAACAAAAGATGAGGAATTTAGGTAACTTAAAACATGAATGAAGTTTCTTTCT
GTGTCGGTTGATCGTGTTTTGGAATTTCGAGTCAGTCTGTTAATTTTGCCTAGGCTAAACCGTAGACGATAGACCTGAGAATTTTTACAAGGAACATGTA
GAATAGGCATCATGAATTTTGGTGTGATTTTTGGACCTTTGTATCATAGGGTAAAAACTCAATTAGTGTGCATAACCGTGTTCTGAAATCTTTAGACAGC
GGCGTTCTTCTTTTTATGTAGTCCAAACCGTAAAAGATAATCATGCTATCTTTTAACAGTAGCTTGTAGACATACCCAGCAGACTCCACGAATTTTGGCT
AAATTTTTTGAGTCTTTGCATCATGGTCTAAAAATTCATAAAACACTACATAGTCCCAACCTAAAAACAGTAGGTAACCTGGTTGTCGAATTTGTGTAGC
CCAATCTAGAGGGATAAAATCTTGGTTCCTTTAGGGTAGCTCAAAAGGTTACACATCTATGCCTTTATGAAAATCATGGTTTCATTGTTTCAAACATTTC
TAGTTNNNNNNNNNNTGAGCTGCACATTTTGTTGCACATCTATGCCTTTATGAAAATCATGGTTTCATTGTATCAAACATTTCTAGTTTCCTCCCTTGAT
GCTTCATTTTCCATCCTTTCGTTTAAACCATATGCTTTTCGTTGGATTTCTTTATTTTCGAAAGTTCTATTTGATTAATGCTTTTGACATGCTATTTGGA
CTTTAAATCATTTATTTTGAAATTATAATTGAGCTGTAGAGTTGGGTCTCCCTGTCTATTGAAAACAAATGACTTTGTTGTGAGCTGGACCCGTGCATTT
TATTACAAACGTGATAAAAATAGCACGTATAGTGCAAGCTAGCTAATTCGGAAACCACACGGAAAATGTTGAATCATCTGAGATTTCG