Detailed information on CNT30104708


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30697762Oryza rufipogonOryza sativa100.0696.3899.491756forward
CNT30604752Oryza rufipogonOryza punctata22.6211.5387.15397forward

Expression of CNT30104708

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
TTDSARNPAPAHRLGFLLGGSPLRSSINAARSSLLFLR*

>peptide 2 (56 aa)
MQPDPRCFFFVEDGPMASFLFSRGHSSPFPLRRGWAGKSVGKGSIGFDLTSFAAVC*

>peptide 3 (67 aa)
DHRFRSQPGSSPPTRFPPRWFSSPLLYKCSPILAAFSSLRMVPWLPSSSRAVILPLFPSAAGGLVSR*

>peptide 4 (32 aa)
MEEFSVAVFDFYLVQLASPVVSFTYGLVLFHN*

>peptide 5 (34 aa)
MRDRLVCVNSCLVRWICHGYFGLDQRLDELKFSL*

>peptide 6 (60 aa)
MFSPFHSRLLLRFWVKITSEIDIIWRPFVCLENSGYLSPSCCAFMVVLSEHRHGHSSPRI*

>peptide 7 (34 aa)
MANCGLLCWVQYARSVGLCQFMFGAMDLSWIFWA*

Sequence

>CNT30104708
CGACCACCGATTCCGCTCGCAACCCGGCTCCAGCCCACCGACTCGGTTTCCTCCTCGGTGGTTCTCCTCTCCGCTCCTCTATAAATGCAGCCCGATCCTC
GCTGCTTTTTCTTCGTTGAGGATGGTCCCATGGCTTCCTTCCTCTTCTCGCGCGGTCATTCTTCCCCTTTTCCCCTCCGCCGCGGGTGGGCTGGTAAGTC
GGTAGGTAAGGGATCAATCGGTTTCGATCTCACCTCGTTCGCTGCCGTTTGTTGATTGATGATCAGGCGCACCAACTAGCCGGATAGATTGCCCGCTTGC
TCGTCCTTTTCTGGTGCTTGATCCGTTCGGTTTGGGGGGGTCTAGTTTCGGCGATTTGCTTCTGCTGTTGTGTTAGTTTTCTGAACACAGTATCTCTTTC
GATTGGTTTATGGCTAATTGTGGTTTGCTGTGTTGGGTACAATATGCGCGATCGGTTGGTTTGTGTCAATTCATGTTTGGTGCGATGGATTTGTCATGGA
TATTTTGGGCTTGATCAAAGGCTAGATGAACTGAAGTTTTCGCTCTGAATTGGTCATGCTATGCAGTTTTTCCTTCGGATCTAGTAATTTTTATGATAAG
GTCAAGTCATATCAGAAATTTTAAGGGCGTTGGAATGATTCTTCTGTGTCAGTTCTTAGTTAAAGTTTAACATCAGGATTTCTCGCGAGGATTTAAGGAG
CTCTTTTTGACCGCCTTCCCTGTGGATTAATTTATCCTAGTACAGGAACTACAGATTACTTGCTGCTTGACCTGCTCAGTTTGAGTTGGTTTGCTTCCAT
TACAAGCAACTGTCCAAGAACATTTTATTTGTAATACGAACATTTATAAACCAGAGAAATTGAAGCTTGTTGTATAGGATTGGTCATTGTTAGGAATAGT
CTTTGGTGTATAAGATGTTTTCTCCATTCCATTCAAGACTGCTGCTACGCTTTTGGGTCAAAATAACAAGTGAGATTGATATTATTTGGAGGCCATTTGT
CTGCTTGGAAAACTCTGGTTATTTAAGTCCATCCTGCTGCGCTTTTATGGTTGTCTTGTCAGAACATAGACATGGCCATAGTTCTCCGAGAATTTGATGT
TAACTTGTTTACTTCCGGAAAAGCTATATCAGTCAGTTATTAACTTGCTGTGAGGGTGGTTATGTAGTAACTAAGAAGACACATCCTAAAGTTTCTGTGG
TAGATGATTCATTTGGCAGTTACTTCTTTCGAACAATATTACAAGGTTGTGAAGGTGATTCTGAAATCTTTTGACTACTTTGGGTGAAATTAATTTGAAG
ATTTATTTCAAGAACATTTATGGACCTCAACATTATAAAGCCATCTGTTTGAAGTTTCTTCTGAGTAGAAACAATTGCTTTATGAACCATGGAGGAGTTC
TCAGTAGCAGTATTTGATTTCTACTTGGTCCAGCTTGCATCTCCAGTAGTATCCTTTACATATGGGCTTGTACTGTTCCATAACTAGCTAGGATATGGGT
TCATTTCAACATATGATTGGCCCTCTTGTATGTTGGTTTGGTGTCATCTTGTAATTTGTGTGTTCATTAAGCTTCCCTCTGATGTTGGAAATTGTAATTA
TCAAATGATATAGACGTCCATATACTGATTTAGTCTGTATAATAGTTGTAACATGGTAATTTGTTTTGATAATCCTGAGTTGTAACATGGTAATTTTGTC
CATATACTGATTTAGTCTGTATAGAATGAAACTCTATGGCTCTTGTGGCATTGTT